تأهل العين الإماراتي إلى الدور نصف النهائي 4 مرات، نجح في التأهل إلى النهائي في 3 مناسبات، وخسر مرة واحدة فقط.
وبدأت مواجهات العين في نصف النهائي بنسخة 2003، عندما لعب أمام داليان شيدا الصيني وفاز الفريق الإماراتي في الذهاب (4-2)، قبل أن يخسر في الإياب (4-3)، ولكنه تأهل بمجموع المباراتين (7-6)، وخسر في النهائي.
ولعب العين في نسخة 2005 أمام شينزين كايزا الصيني، وحسم مباراة الذهاب (6-0)، قبل أن يتعادل في الإياب (0-0)، وخسر اللقب في النهائي أمام اتحاد جدة.
وواجه العين نظيره الهلال السعودي في نصف نهائي البطولة نسخة 2014، وخسر الذهاب (3-0)، وفاز في الإياب (2-1)، ولكنه ودع المنافسات بالخسارة (4-2) بمجموع المباراتين.
وفي نسخة 2016، لعب العين أمام الجيش القطري وفاز في الذهاب (3-1)، وتعادل في الإياب (2-2)، ليتأهل إلى النهائي ويخسره أمام جونبك هيونداي الكوري الجنوبي.